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윤석열 대통령에 대한 검찰의 구속 기소를 두고 여야의 극명한 대립이 발생했다. 국민의힘은 공수처의 불법 수사와 검찰의 부실 기소를 주장하며, 검찰총장의 사퇴와 법원의 공소 기각을 요구했다. 특히, 신동욱 수석대변인은 검찰을 공수처의 ‘기소 하청기관’으로 비난하며 강하게 반발했다. 윤상현 의원 또한 공수처의 불법 수사를 비판하고 검찰총장의 사퇴를 촉구했다. 홍준표 대구시장은 검찰의 기소 과정에 대한 재조사 필요성을 언급했다. 반면, 더불어민주당은 대통령의 구속 기소를 ‘내란 수괴에 대한 단죄의 시작’으로 규정하며, 법원의 엄정한 판결을 촉구했다. 한민수 대변인은 윤 대통령에게 법 앞의 평등을 강조하며 재판에 성실히 임할 것을 요구했다. 민주당 의원들은 검찰총장의 결정이 늦어진 점에 대해 우려를 표했으나, 결국 기소된 것에 안도하는 모습을 보였다. 이언주 의원은 수사기관의 공적 의지를 강조하며 남은 수사와 공소 유지에 최선을 다할 것을 요청했다. 결국 여야는 법원에 서로 상반되는 주문을 하며 대립을 이어갔다.